しょうゆは開栓前であっても時間がたつとともに少しずつ色が濃くなり、風味も落ちてきます。そのため、保存においては、直射日光を避け、なるべく涼しいところに置くなど注意が必要です。開栓前は、基本的に長期保存しても酸敗・腐敗しにくいものですが、本来のおいしさを味わうためにもお早めにおめしあがりいただくことをおすすめします。また、開栓後は空気に触れることで急速に酸化が進むため、きちんと栓をし、冷暗所に保存する必要があります。これはカビを防ぐことにもなるので、家庭で保存する場合には、冷蔵庫にしまうのが最適です。冷蔵庫に保管してある容器から、使いきる分だけ小型の容器に移し替えて使用することも、品質の保持にはよい方法。このように保存法に気をつけたうえで、1カ月くらいで使いきるのが理想的です。
